Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BFSP2Q13515 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BFSP2Q13515 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BFSP2Q13515 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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