Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED1Q13445 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
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TMED1Q13445 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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TMED1Q13445 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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TMED1Q13445 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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TMED1Q13445 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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TMED1Q13445 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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