Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
AP3B2Q13367 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AP3B2Q13367 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AP3B2Q13367 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
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