Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITGB3BPQ13352 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGB3BPQ13352 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
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