Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MAP3K1Q13233 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
MAP3K1Q13233 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
MAP3K1Q13233 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
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