Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPS1Q13098 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPS1Q13098 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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