Protein–RNA interactions for Protein: Q13065

GAGE1, G antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAGE1Q13065 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GAGE1Q13065 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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GAGE1Q13065 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GAGE1Q13065 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms