Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK3Q13003 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRIK3Q13003 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
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