Protein–RNA interactions for Protein: Q12815

TROAP, Tastin, humanhuman

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Length 778 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAPQ12815 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TROAPQ12815 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROAPQ12815 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
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