Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LMOD3Q0VAK6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMOD3Q0VAK6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMOD3Q0VAK6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms