Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDE4BQ07343 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE4BQ07343 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms