Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GBE1Q04446 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GBE1Q04446 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms