Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RELAQ04206 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RELAQ04206 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RELAQ04206 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RELAQ04206 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RELAQ04206 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RELAQ04206 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RELAQ04206 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RELAQ04206 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RELAQ04206 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RELAQ04206 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RELAQ04206 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RELAQ04206 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RELAQ04206 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RELAQ04206 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RELAQ04206 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RELAQ04206 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RELAQ04206 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RELAQ04206 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELAQ04206 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELAQ04206 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELAQ04206 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELAQ04206 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELAQ04206 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELAQ04206 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELAQ04206 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELAQ04206 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELAQ04206 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RELAQ04206 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELAQ04206 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELAQ04206 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELAQ04206 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELAQ04206 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELAQ04206 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RELAQ04206 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RELAQ04206 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RELAQ04206 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RELAQ04206 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RELAQ04206 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RELAQ04206 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RELAQ04206 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RELAQ04206 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RELAQ04206 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELAQ04206 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELAQ04206 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELAQ04206 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELAQ04206 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELAQ04206 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELAQ04206 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELAQ04206 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELAQ04206 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELAQ04206 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RELAQ04206 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELAQ04206 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELAQ04206 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELAQ04206 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELAQ04206 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RELAQ04206 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RELAQ04206 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RELAQ04206 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RELAQ04206 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RELAQ04206 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RELAQ04206 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RELAQ04206 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RELAQ04206 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RELAQ04206 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RELAQ04206 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RELAQ04206 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RELAQ04206 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELAQ04206 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELAQ04206 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELAQ04206 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELAQ04206 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELAQ04206 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELAQ04206 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RELAQ04206 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELAQ04206 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELAQ04206 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELAQ04206 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELAQ04206 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RELAQ04206 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RELAQ04206 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RELAQ04206 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RELAQ04206 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RELAQ04206 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RELAQ04206 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RELAQ04206 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RELAQ04206 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RELAQ04206 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RELAQ04206 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RELAQ04206 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RELAQ04206 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RELAQ04206 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RELAQ04206 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RELAQ04206 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RELAQ04206 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RELAQ04206 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RELAQ04206 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RELAQ04206 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RELAQ04206 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms