Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPARDQ03181 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPARDQ03181 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARDQ03181 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARDQ03181 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARDQ03181 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARDQ03181 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARDQ03181 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARDQ03181 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARDQ03181 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARDQ03181 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARDQ03181 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARDQ03181 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARDQ03181 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARDQ03181 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPARDQ03181 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPARDQ03181 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPARDQ03181 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPARDQ03181 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPARDQ03181 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPARDQ03181 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPARDQ03181 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PPARDQ03181 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPARDQ03181 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPARDQ03181 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms