Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GCNT1Q02742 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GCNT1Q02742 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms