Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MS4A2Q01362 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MS4A2Q01362 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MS4A2Q01362 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms