Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDK16Q00536 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDK16Q00536 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK16Q00536 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms