Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASIC1P78348 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC1P78348 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms