Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBX1P62877 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBX1P62877 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBX1P62877 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBX1P62877 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBX1P62877 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBX1P62877 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBX1P62877 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBX1P62877 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBX1P62877 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBX1P62877 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBX1P62877 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBX1P62877 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBX1P62877 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBX1P62877 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBX1P62877 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBX1P62877 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBX1P62877 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBX1P62877 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBX1P62877 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBX1P62877 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBX1P62877 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBX1P62877 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBX1P62877 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBX1P62877 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBX1P62877 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBX1P62877 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBX1P62877 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBX1P62877 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBX1P62877 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBX1P62877 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBX1P62877 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBX1P62877 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBX1P62877 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBX1P62877 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBX1P62877 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBX1P62877 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBX1P62877 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBX1P62877 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBX1P62877 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RBX1P62877 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBX1P62877 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBX1P62877 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBX1P62877 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBX1P62877 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBX1P62877 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBX1P62877 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBX1P62877 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBX1P62877 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBX1P62877 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBX1P62877 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBX1P62877 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBX1P62877 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RBX1P62877 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBX1P62877 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBX1P62877 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBX1P62877 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBX1P62877 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBX1P62877 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBX1P62877 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RBX1P62877 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBX1P62877 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBX1P62877 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBX1P62877 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBX1P62877 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBX1P62877 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBX1P62877 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBX1P62877 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBX1P62877 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBX1P62877 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBX1P62877 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBX1P62877 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBX1P62877 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBX1P62877 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBX1P62877 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBX1P62877 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBX1P62877 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBX1P62877 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBX1P62877 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBX1P62877 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RBX1P62877 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBX1P62877 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBX1P62877 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBX1P62877 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBX1P62877 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBX1P62877 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBX1P62877 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBX1P62877 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBX1P62877 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBX1P62877 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBX1P62877 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBX1P62877 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RBX1P62877 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBX1P62877 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBX1P62877 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBX1P62877 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBX1P62877 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBX1P62877 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBX1P62877 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RBX1P62877 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms