Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL23P62829 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL23P62829 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL23P62829 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL23P62829 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL23P62829 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL23P62829 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL23P62829 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL23P62829 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL23P62829 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL23P62829 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL23P62829 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL23P62829 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL23P62829 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL23P62829 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL23P62829 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL23P62829 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL23P62829 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL23P62829 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL23P62829 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL23P62829 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL23P62829 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL23P62829 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL23P62829 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL23P62829 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL23P62829 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL23P62829 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL23P62829 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL23P62829 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL23P62829 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL23P62829 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL23P62829 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL23P62829 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL23P62829 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL23P62829 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL23P62829 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL23P62829 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL23P62829 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL23P62829 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL23P62829 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL23P62829 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL23P62829 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL23P62829 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL23P62829 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL23P62829 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL23P62829 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL23P62829 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL23P62829 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL23P62829 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL23P62829 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL23P62829 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL23P62829 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL23P62829 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL23P62829 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL23P62829 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL23P62829 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL23P62829 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL23P62829 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL23P62829 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL23P62829 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL23P62829 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPL23P62829 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL23P62829 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL23P62829 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL23P62829 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL23P62829 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL23P62829 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL23P62829 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL23P62829 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL23P62829 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL23P62829 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL23P62829 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL23P62829 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL23P62829 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL23P62829 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL23P62829 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL23P62829 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL23P62829 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPL23P62829 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL23P62829 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL23P62829 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL23P62829 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL23P62829 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL23P62829 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL23P62829 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL23P62829 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL23P62829 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL23P62829 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL23P62829 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL23P62829 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPL23P62829 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL23P62829 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL23P62829 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL23P62829 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL23P62829 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL23P62829 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL23P62829 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL23P62829 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL23P62829 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPL23P62829 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms