Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOBP62745 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOBP62745 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOBP62745 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOBP62745 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOBP62745 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOBP62745 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOBP62745 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RHOBP62745 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOBP62745 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOBP62745 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOBP62745 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOBP62745 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOBP62745 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOBP62745 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOBP62745 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOBP62745 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOBP62745 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOBP62745 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOBP62745 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOBP62745 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOBP62745 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOBP62745 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOBP62745 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOBP62745 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOBP62745 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOBP62745 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOBP62745 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOBP62745 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOBP62745 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOBP62745 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOBP62745 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOBP62745 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOBP62745 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOBP62745 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOBP62745 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOBP62745 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOBP62745 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOBP62745 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOBP62745 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOBP62745 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOBP62745 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOBP62745 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOBP62745 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOBP62745 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOBP62745 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOBP62745 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOBP62745 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOBP62745 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOBP62745 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOBP62745 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOBP62745 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOBP62745 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOBP62745 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOBP62745 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOBP62745 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOBP62745 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOBP62745 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOBP62745 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOBP62745 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOBP62745 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOBP62745 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOBP62745 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOBP62745 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOBP62745 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOBP62745 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOBP62745 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOBP62745 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOBP62745 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOBP62745 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOBP62745 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOBP62745 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOBP62745 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOBP62745 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOBP62745 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOBP62745 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOBP62745 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOBP62745 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOBP62745 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOBP62745 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOBP62745 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOBP62745 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOBP62745 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOBP62745 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOBP62745 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOBP62745 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOBP62745 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOBP62745 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOBP62745 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOBP62745 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOBP62745 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOBP62745 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOBP62745 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOBP62745 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOBP62745 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOBP62745 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOBP62745 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOBP62745 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOBP62745 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHOBP62745 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms