Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRP54P61011 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRP54P61011 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRP54P61011 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRP54P61011 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRP54P61011 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRP54P61011 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRP54P61011 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRP54P61011 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRP54P61011 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRP54P61011 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRP54P61011 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRP54P61011 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SRP54P61011 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRP54P61011 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRP54P61011 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRP54P61011 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRP54P61011 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRP54P61011 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRP54P61011 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRP54P61011 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRP54P61011 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRP54P61011 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRP54P61011 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRP54P61011 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRP54P61011 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRP54P61011 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRP54P61011 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRP54P61011 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRP54P61011 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SRP54P61011 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRP54P61011 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRP54P61011 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRP54P61011 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRP54P61011 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRP54P61011 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRP54P61011 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRP54P61011 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRP54P61011 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRP54P61011 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRP54P61011 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRP54P61011 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRP54P61011 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRP54P61011 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SRP54P61011 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP54P61011 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP54P61011 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP54P61011 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP54P61011 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP54P61011 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP54P61011 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP54P61011 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP54P61011 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SRP54P61011 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP54P61011 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP54P61011 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP54P61011 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP54P61011 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP54P61011 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP54P61011 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP54P61011 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP54P61011 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP54P61011 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP54P61011 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP54P61011 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP54P61011 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP54P61011 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP54P61011 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRP54P61011 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP54P61011 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP54P61011 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP54P61011 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP54P61011 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP54P61011 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP54P61011 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP54P61011 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP54P61011 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP54P61011 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP54P61011 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP54P61011 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP54P61011 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP54P61011 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP54P61011 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP54P61011 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRP54P61011 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP54P61011 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP54P61011 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP54P61011 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP54P61011 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP54P61011 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP54P61011 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP54P61011 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP54P61011 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP54P61011 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP54P61011 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP54P61011 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SRP54P61011 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SRP54P61011 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP54P61011 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SRP54P61011 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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