Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3EP60228 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EIF3EP60228 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3EP60228 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms