Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP107P57740 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP107P57740 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP107P57740 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP107P57740 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP107P57740 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP107P57740 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP107P57740 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP107P57740 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP107P57740 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP107P57740 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP107P57740 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP107P57740 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP107P57740 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP107P57740 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP107P57740 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP107P57740 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP107P57740 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP107P57740 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP107P57740 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP107P57740 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP107P57740 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP107P57740 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP107P57740 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP107P57740 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP107P57740 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP107P57740 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP107P57740 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP107P57740 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP107P57740 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP107P57740 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP107P57740 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP107P57740 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP107P57740 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP107P57740 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP107P57740 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP107P57740 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NUP107P57740 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NUP107P57740 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP107P57740 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP107P57740 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP107P57740 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP107P57740 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP107P57740 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP107P57740 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP107P57740 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP107P57740 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP107P57740 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP107P57740 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP107P57740 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP107P57740 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP107P57740 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP107P57740 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP107P57740 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP107P57740 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP107P57740 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP107P57740 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP107P57740 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP107P57740 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NUP107P57740 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP107P57740 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP107P57740 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NUP107P57740 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP107P57740 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP107P57740 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP107P57740 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP107P57740 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP107P57740 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP107P57740 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP107P57740 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP107P57740 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP107P57740 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP107P57740 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP107P57740 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP107P57740 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP107P57740 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP107P57740 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP107P57740 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP107P57740 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP107P57740 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP107P57740 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP107P57740 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP107P57740 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP107P57740 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP107P57740 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP107P57740 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP107P57740 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP107P57740 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP107P57740 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP107P57740 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP107P57740 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP107P57740 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP107P57740 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP107P57740 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP107P57740 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP107P57740 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP107P57740 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP107P57740 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP107P57740 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP107P57740 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms