Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF3P57682 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF3P57682 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF3P57682 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF3P57682 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF3P57682 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF3P57682 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF3P57682 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF3P57682 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF3P57682 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLF3P57682 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLF3P57682 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLF3P57682 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLF3P57682 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLF3P57682 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLF3P57682 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLF3P57682 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLF3P57682 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF3P57682 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF3P57682 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF3P57682 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF3P57682 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF3P57682 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF3P57682 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF3P57682 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF3P57682 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF3P57682 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF3P57682 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF3P57682 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF3P57682 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF3P57682 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF3P57682 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF3P57682 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF3P57682 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF3P57682 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF3P57682 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF3P57682 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF3P57682 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF3P57682 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLF3P57682 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF3P57682 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF3P57682 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF3P57682 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF3P57682 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF3P57682 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF3P57682 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF3P57682 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF3P57682 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF3P57682 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF3P57682 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF3P57682 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF3P57682 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF3P57682 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF3P57682 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLF3P57682 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF3P57682 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF3P57682 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF3P57682 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF3P57682 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF3P57682 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF3P57682 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF3P57682 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF3P57682 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF3P57682 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF3P57682 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF3P57682 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF3P57682 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF3P57682 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLF3P57682 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF3P57682 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF3P57682 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF3P57682 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF3P57682 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF3P57682 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF3P57682 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF3P57682 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF3P57682 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF3P57682 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF3P57682 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF3P57682 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF3P57682 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF3P57682 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF3P57682 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF3P57682 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLF3P57682 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF3P57682 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF3P57682 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF3P57682 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF3P57682 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF3P57682 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF3P57682 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF3P57682 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF3P57682 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF3P57682 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF3P57682 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF3P57682 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF3P57682 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLF3P57682 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF3P57682 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLF3P57682 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms