Protein–RNA interactions for Protein: P56470

LGALS4, Galectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS4P56470 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LGALS4P56470 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LGALS4P56470 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms