Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH13P55290 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH13P55290 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDH13P55290 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH13P55290 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH13P55290 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH13P55290 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH13P55290 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH13P55290 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH13P55290 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH13P55290 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH13P55290 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH13P55290 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH13P55290 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH13P55290 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH13P55290 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDH13P55290 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH13P55290 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH13P55290 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH13P55290 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH13P55290 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH13P55290 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH13P55290 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH13P55290 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH13P55290 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH13P55290 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH13P55290 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH13P55290 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH13P55290 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH13P55290 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH13P55290 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH13P55290 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH13P55290 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH13P55290 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH13P55290 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH13P55290 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH13P55290 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDH13P55290 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH13P55290 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH13P55290 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH13P55290 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH13P55290 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH13P55290 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH13P55290 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH13P55290 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH13P55290 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH13P55290 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH13P55290 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH13P55290 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH13P55290 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH13P55290 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH13P55290 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH13P55290 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH13P55290 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDH13P55290 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH13P55290 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH13P55290 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH13P55290 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH13P55290 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH13P55290 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH13P55290 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH13P55290 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH13P55290 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH13P55290 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH13P55290 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH13P55290 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDH13P55290 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH13P55290 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH13P55290 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH13P55290 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH13P55290 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH13P55290 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH13P55290 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH13P55290 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH13P55290 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH13P55290 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH13P55290 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH13P55290 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH13P55290 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH13P55290 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH13P55290 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH13P55290 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDH13P55290 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH13P55290 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH13P55290 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH13P55290 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH13P55290 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH13P55290 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH13P55290 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH13P55290 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH13P55290 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH13P55290 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH13P55290 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH13P55290 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH13P55290 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH13P55290 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH13P55290 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH13P55290 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH13P55290 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH13P55290 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms