Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEMP55040 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEMP55040 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEMP55040 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEMP55040 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEMP55040 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEMP55040 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEMP55040 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GEMP55040 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEMP55040 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEMP55040 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEMP55040 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GEMP55040 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEMP55040 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEMP55040 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEMP55040 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEMP55040 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEMP55040 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEMP55040 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEMP55040 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEMP55040 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEMP55040 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEMP55040 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEMP55040 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEMP55040 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEMP55040 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEMP55040 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEMP55040 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GEMP55040 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEMP55040 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEMP55040 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GEMP55040 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GEMP55040 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GEMP55040 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GEMP55040 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GEMP55040 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GEMP55040 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GEMP55040 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GEMP55040 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GEMP55040 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GEMP55040 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GEMP55040 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GEMP55040 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GEMP55040 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GEMP55040 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEMP55040 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEMP55040 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEMP55040 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEMP55040 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEMP55040 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GEMP55040 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEMP55040 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEMP55040 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEMP55040 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEMP55040 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEMP55040 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEMP55040 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEMP55040 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEMP55040 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GEMP55040 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GEMP55040 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GEMP55040 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GEMP55040 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GEMP55040 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GEMP55040 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GEMP55040 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GEMP55040 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GEMP55040 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEMP55040 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEMP55040 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEMP55040 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEMP55040 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEMP55040 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEMP55040 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEMP55040 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEMP55040 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEMP55040 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEMP55040 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GEMP55040 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEMP55040 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEMP55040 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GEMP55040 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEMP55040 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEMP55040 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEMP55040 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GEMP55040 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEMP55040 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEMP55040 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEMP55040 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEMP55040 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEMP55040 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEMP55040 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEMP55040 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEMP55040 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEMP55040 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEMP55040 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEMP55040 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEMP55040 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEMP55040 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEMP55040 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms