Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AIF1P55008 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AIF1P55008 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AIF1P55008 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AIF1P55008 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AIF1P55008 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AIF1P55008 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AIF1P55008 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AIF1P55008 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AIF1P55008 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AIF1P55008 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AIF1P55008 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AIF1P55008 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AIF1P55008 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AIF1P55008 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AIF1P55008 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AIF1P55008 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AIF1P55008 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AIF1P55008 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AIF1P55008 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AIF1P55008 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AIF1P55008 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AIF1P55008 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AIF1P55008 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AIF1P55008 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AIF1P55008 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AIF1P55008 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AIF1P55008 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AIF1P55008 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AIF1P55008 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AIF1P55008 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AIF1P55008 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AIF1P55008 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AIF1P55008 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AIF1P55008 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AIF1P55008 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AIF1P55008 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AIF1P55008 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AIF1P55008 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AIF1P55008 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AIF1P55008 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AIF1P55008 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AIF1P55008 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AIF1P55008 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AIF1P55008 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AIF1P55008 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AIF1P55008 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AIF1P55008 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AIF1P55008 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AIF1P55008 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AIF1P55008 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AIF1P55008 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AIF1P55008 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AIF1P55008 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AIF1P55008 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AIF1P55008 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AIF1P55008 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AIF1P55008 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AIF1P55008 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AIF1P55008 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AIF1P55008 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AIF1P55008 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
AIF1P55008 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AIF1P55008 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AIF1P55008 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AIF1P55008 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AIF1P55008 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AIF1P55008 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AIF1P55008 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
AIF1P55008 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AIF1P55008 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AIF1P55008 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AIF1P55008 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIF1P55008 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIF1P55008 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIF1P55008 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIF1P55008 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AIF1P55008 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIF1P55008 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIF1P55008 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIF1P55008 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIF1P55008 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIF1P55008 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIF1P55008 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIF1P55008 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIF1P55008 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIF1P55008 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIF1P55008 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIF1P55008 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIF1P55008 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIF1P55008 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIF1P55008 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AIF1P55008 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AIF1P55008 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AIF1P55008 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AIF1P55008 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AIF1P55008 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AIF1P55008 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AIF1P55008 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AIF1P55008 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms