Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA2D1P54289 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms