Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPAP53621 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPAP53621 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPAP53621 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COPAP53621 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPAP53621 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COPAP53621 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPAP53621 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COPAP53621 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPAP53621 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPAP53621 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPAP53621 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPAP53621 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPAP53621 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPAP53621 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPAP53621 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPAP53621 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPAP53621 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPAP53621 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPAP53621 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPAP53621 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPAP53621 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPAP53621 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPAP53621 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPAP53621 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COPAP53621 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPAP53621 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPAP53621 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPAP53621 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPAP53621 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPAP53621 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPAP53621 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPAP53621 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPAP53621 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPAP53621 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COPAP53621 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPAP53621 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPAP53621 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPAP53621 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPAP53621 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPAP53621 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPAP53621 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPAP53621 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPAP53621 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPAP53621 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPAP53621 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPAP53621 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPAP53621 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPAP53621 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COPAP53621 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPAP53621 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPAP53621 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPAP53621 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPAP53621 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPAP53621 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPAP53621 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPAP53621 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPAP53621 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPAP53621 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPAP53621 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPAP53621 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COPAP53621 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
COPAP53621 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPAP53621 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COPAP53621 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPAP53621 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPAP53621 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPAP53621 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COPAP53621 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPAP53621 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPAP53621 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPAP53621 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPAP53621 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPAP53621 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPAP53621 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPAP53621 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPAP53621 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPAP53621 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPAP53621 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPAP53621 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPAP53621 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPAP53621 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPAP53621 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPAP53621 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPAP53621 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPAP53621 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPAP53621 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPAP53621 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPAP53621 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPAP53621 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPAP53621 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPAP53621 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPAP53621 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPAP53621 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPAP53621 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPAP53621 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPAP53621 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPAP53621 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPAP53621 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPAP53621 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms