Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF140P52738 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF140P52738 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms