Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LUMP51884 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LUMP51884 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LUMP51884 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LUMP51884 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LUMP51884 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LUMP51884 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LUMP51884 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LUMP51884 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LUMP51884 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LUMP51884 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LUMP51884 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LUMP51884 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LUMP51884 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LUMP51884 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LUMP51884 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LUMP51884 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LUMP51884 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LUMP51884 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LUMP51884 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LUMP51884 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LUMP51884 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LUMP51884 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LUMP51884 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LUMP51884 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LUMP51884 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LUMP51884 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LUMP51884 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LUMP51884 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LUMP51884 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LUMP51884 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LUMP51884 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LUMP51884 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LUMP51884 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LUMP51884 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LUMP51884 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LUMP51884 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LUMP51884 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LUMP51884 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LUMP51884 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LUMP51884 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LUMP51884 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LUMP51884 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LUMP51884 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LUMP51884 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LUMP51884 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LUMP51884 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LUMP51884 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LUMP51884 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LUMP51884 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LUMP51884 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LUMP51884 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LUMP51884 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LUMP51884 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LUMP51884 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LUMP51884 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LUMP51884 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LUMP51884 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LUMP51884 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LUMP51884 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LUMP51884 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LUMP51884 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LUMP51884 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LUMP51884 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LUMP51884 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LUMP51884 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LUMP51884 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LUMP51884 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LUMP51884 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LUMP51884 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LUMP51884 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LUMP51884 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LUMP51884 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LUMP51884 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LUMP51884 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LUMP51884 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LUMP51884 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LUMP51884 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LUMP51884 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LUMP51884 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LUMP51884 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LUMP51884 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LUMP51884 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LUMP51884 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LUMP51884 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LUMP51884 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LUMP51884 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LUMP51884 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LUMP51884 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LUMP51884 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LUMP51884 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LUMP51884 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LUMP51884 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LUMP51884 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LUMP51884 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LUMP51884 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LUMP51884 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LUMP51884 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LUMP51884 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LUMP51884 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms