Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCN3P51790 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLCN3P51790 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCN3P51790 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCN3P51790 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCN3P51790 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCN3P51790 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCN3P51790 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCN3P51790 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCN3P51790 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCN3P51790 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCN3P51790 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCN3P51790 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCN3P51790 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCN3P51790 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCN3P51790 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCN3P51790 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCN3P51790 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCN3P51790 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCN3P51790 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms