Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB5CP51148 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms