Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBP50607 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBP50607 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBP50607 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBP50607 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBP50607 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBP50607 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBP50607 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBP50607 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBP50607 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBP50607 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBP50607 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBP50607 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBP50607 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBP50607 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBP50607 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBP50607 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBP50607 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBP50607 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBP50607 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBP50607 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBP50607 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBP50607 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBP50607 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBP50607 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBP50607 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBP50607 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBP50607 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBP50607 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBP50607 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBP50607 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBP50607 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBP50607 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBP50607 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBP50607 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBP50607 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBP50607 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBP50607 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBP50607 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBP50607 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBP50607 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBP50607 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBP50607 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBP50607 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBP50607 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBP50607 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBP50607 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBP50607 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBP50607 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBP50607 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBP50607 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBP50607 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBP50607 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBP50607 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBP50607 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBP50607 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBP50607 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBP50607 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBP50607 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBP50607 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBP50607 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBP50607 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBP50607 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBP50607 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBP50607 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBP50607 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBP50607 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBP50607 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBP50607 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBP50607 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBP50607 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBP50607 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBP50607 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBP50607 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBP50607 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBP50607 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBP50607 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBP50607 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBP50607 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBP50607 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBP50607 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBP50607 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBP50607 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBP50607 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBP50607 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBP50607 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBP50607 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBP50607 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBP50607 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBP50607 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBP50607 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBP50607 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBP50607 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBP50607 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBP50607 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBP50607 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBP50607 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBP50607 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBP50607 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBP50607 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms