Protein–RNA interactions for Protein: P50552

VASP, Vasodilator-stimulated phosphoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASPP50552 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VASPP50552 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VASPP50552 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VASPP50552 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VASPP50552 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VASPP50552 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VASPP50552 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VASPP50552 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VASPP50552 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VASPP50552 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VASPP50552 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VASPP50552 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VASPP50552 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VASPP50552 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VASPP50552 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VASPP50552 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VASPP50552 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VASPP50552 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VASPP50552 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VASPP50552 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VASPP50552 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VASPP50552 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VASPP50552 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VASPP50552 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VASPP50552 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VASPP50552 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VASPP50552 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VASPP50552 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VASPP50552 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VASPP50552 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VASPP50552 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VASPP50552 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VASPP50552 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VASPP50552 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VASPP50552 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VASPP50552 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VASPP50552 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VASPP50552 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VASPP50552 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VASPP50552 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VASPP50552 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VASPP50552 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VASPP50552 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VASPP50552 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VASPP50552 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VASPP50552 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VASPP50552 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VASPP50552 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VASPP50552 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VASPP50552 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VASPP50552 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VASPP50552 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VASPP50552 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VASPP50552 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VASPP50552 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VASPP50552 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VASPP50552 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VASPP50552 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VASPP50552 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VASPP50552 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VASPP50552 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VASPP50552 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VASPP50552 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VASPP50552 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VASPP50552 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VASPP50552 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VASPP50552 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VASPP50552 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VASPP50552 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VASPP50552 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VASPP50552 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VASPP50552 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VASPP50552 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VASPP50552 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VASPP50552 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VASPP50552 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VASPP50552 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VASPP50552 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VASPP50552 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VASPP50552 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VASPP50552 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VASPP50552 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VASPP50552 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VASPP50552 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VASPP50552 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VASPP50552 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VASPP50552 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VASPP50552 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VASPP50552 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VASPP50552 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VASPP50552 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VASPP50552 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VASPP50552 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VASPP50552 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VASPP50552 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VASPP50552 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VASPP50552 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VASPP50552 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VASPP50552 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VASPP50552 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms