Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSRP3P50461 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRP3P50461 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms