Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GSK3BP49841 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GSK3BP49841 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms