Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARRES1P49788 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARRES1P49788 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RARRES1P49788 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms