Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN1P49768 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSEN1P49768 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSEN1P49768 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms