Protein–RNA interactions for Protein: P49763

PGF, Placenta growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGFP49763 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGFP49763 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGFP49763 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGFP49763 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGFP49763 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGFP49763 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PGFP49763 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGFP49763 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PGFP49763 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGFP49763 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGFP49763 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGFP49763 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGFP49763 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGFP49763 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGFP49763 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGFP49763 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGFP49763 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGFP49763 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGFP49763 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGFP49763 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGFP49763 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGFP49763 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGFP49763 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGFP49763 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGFP49763 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGFP49763 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGFP49763 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGFP49763 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGFP49763 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGFP49763 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGFP49763 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGFP49763 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGFP49763 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGFP49763 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGFP49763 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGFP49763 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGFP49763 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PGFP49763 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGFP49763 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGFP49763 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGFP49763 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGFP49763 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGFP49763 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGFP49763 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGFP49763 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGFP49763 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGFP49763 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGFP49763 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGFP49763 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGFP49763 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGFP49763 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGFP49763 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGFP49763 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGFP49763 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGFP49763 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGFP49763 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGFP49763 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGFP49763 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGFP49763 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGFP49763 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGFP49763 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGFP49763 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGFP49763 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PGFP49763 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGFP49763 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGFP49763 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PGFP49763 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGFP49763 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGFP49763 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PGFP49763 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGFP49763 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGFP49763 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PGFP49763 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGFP49763 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGFP49763 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGFP49763 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGFP49763 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGFP49763 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGFP49763 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGFP49763 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGFP49763 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGFP49763 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGFP49763 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGFP49763 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGFP49763 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGFP49763 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGFP49763 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGFP49763 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGFP49763 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGFP49763 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PGFP49763 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGFP49763 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGFP49763 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGFP49763 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGFP49763 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGFP49763 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PGFP49763 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGFP49763 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGFP49763 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGFP49763 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms