Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms