Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP5P45974 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP5P45974 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP5P45974 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP5P45974 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP5P45974 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP5P45974 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP5P45974 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP5P45974 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP5P45974 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP5P45974 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP5P45974 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP5P45974 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP5P45974 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP5P45974 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP5P45974 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
USP5P45974 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
USP5P45974 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP5P45974 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP5P45974 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP5P45974 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP5P45974 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP5P45974 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP5P45974 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP5P45974 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
USP5P45974 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP5P45974 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP5P45974 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP5P45974 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP5P45974 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP5P45974 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP5P45974 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP5P45974 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP5P45974 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP5P45974 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP5P45974 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP5P45974 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USP5P45974 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP5P45974 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP5P45974 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP5P45974 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP5P45974 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP5P45974 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP5P45974 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP5P45974 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP5P45974 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP5P45974 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP5P45974 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP5P45974 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP5P45974 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP5P45974 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP5P45974 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP5P45974 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP5P45974 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP5P45974 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP5P45974 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP5P45974 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP5P45974 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP5P45974 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP5P45974 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP5P45974 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP5P45974 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP5P45974 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP5P45974 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP5P45974 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP5P45974 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP5P45974 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP5P45974 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP5P45974 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP5P45974 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP5P45974 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP5P45974 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
USP5P45974 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP5P45974 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
USP5P45974 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP5P45974 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP5P45974 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP5P45974 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP5P45974 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP5P45974 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP5P45974 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP5P45974 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP5P45974 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP5P45974 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP5P45974 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP5P45974 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP5P45974 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP5P45974 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP5P45974 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
USP5P45974 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP5P45974 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP5P45974 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP5P45974 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP5P45974 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP5P45974 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP5P45974 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP5P45974 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP5P45974 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP5P45974 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP5P45974 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms