Protein–RNA interactions for Protein: P42785

PRCP, Lysosomal Pro-X carboxypeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCPP42785 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRCPP42785 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRCPP42785 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRCPP42785 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRCPP42785 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRCPP42785 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRCPP42785 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRCPP42785 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRCPP42785 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRCPP42785 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRCPP42785 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRCPP42785 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRCPP42785 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRCPP42785 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRCPP42785 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRCPP42785 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRCPP42785 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRCPP42785 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRCPP42785 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRCPP42785 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRCPP42785 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRCPP42785 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRCPP42785 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRCPP42785 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRCPP42785 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRCPP42785 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRCPP42785 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRCPP42785 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRCPP42785 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRCPP42785 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRCPP42785 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRCPP42785 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRCPP42785 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRCPP42785 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRCPP42785 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRCPP42785 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRCPP42785 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRCPP42785 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRCPP42785 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRCPP42785 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRCPP42785 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRCPP42785 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRCPP42785 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRCPP42785 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRCPP42785 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRCPP42785 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRCPP42785 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRCPP42785 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRCPP42785 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRCPP42785 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRCPP42785 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRCPP42785 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRCPP42785 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRCPP42785 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRCPP42785 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRCPP42785 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRCPP42785 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRCPP42785 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRCPP42785 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRCPP42785 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRCPP42785 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRCPP42785 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRCPP42785 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRCPP42785 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRCPP42785 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRCPP42785 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRCPP42785 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRCPP42785 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRCPP42785 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRCPP42785 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRCPP42785 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRCPP42785 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRCPP42785 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRCPP42785 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRCPP42785 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRCPP42785 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRCPP42785 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRCPP42785 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRCPP42785 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRCPP42785 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRCPP42785 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRCPP42785 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRCPP42785 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRCPP42785 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRCPP42785 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRCPP42785 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRCPP42785 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRCPP42785 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRCPP42785 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRCPP42785 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRCPP42785 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRCPP42785 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRCPP42785 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRCPP42785 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRCPP42785 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRCPP42785 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRCPP42785 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRCPP42785 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRCPP42785 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRCPP42785 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms