Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC5P40937 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC5P40937 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC5P40937 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC5P40937 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC5P40937 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFC5P40937 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC5P40937 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC5P40937 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC5P40937 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC5P40937 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC5P40937 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC5P40937 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC5P40937 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFC5P40937 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC5P40937 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC5P40937 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC5P40937 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC5P40937 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC5P40937 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC5P40937 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC5P40937 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFC5P40937 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC5P40937 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC5P40937 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC5P40937 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC5P40937 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC5P40937 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC5P40937 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC5P40937 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC5P40937 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC5P40937 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC5P40937 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC5P40937 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFC5P40937 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC5P40937 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC5P40937 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC5P40937 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC5P40937 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC5P40937 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC5P40937 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC5P40937 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC5P40937 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC5P40937 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC5P40937 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC5P40937 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFC5P40937 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC5P40937 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC5P40937 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC5P40937 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC5P40937 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC5P40937 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC5P40937 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC5P40937 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC5P40937 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC5P40937 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC5P40937 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC5P40937 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC5P40937 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC5P40937 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC5P40937 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC5P40937 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC5P40937 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC5P40937 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC5P40937 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC5P40937 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC5P40937 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFC5P40937 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFC5P40937 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC5P40937 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC5P40937 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC5P40937 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC5P40937 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC5P40937 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC5P40937 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC5P40937 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC5P40937 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC5P40937 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC5P40937 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC5P40937 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC5P40937 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC5P40937 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC5P40937 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC5P40937 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC5P40937 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC5P40937 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC5P40937 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC5P40937 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC5P40937 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC5P40937 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC5P40937 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC5P40937 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC5P40937 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC5P40937 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC5P40937 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC5P40937 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC5P40937 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC5P40937 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC5P40937 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC5P40937 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms