Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP6V1E1P36543 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP6V1E1P36543 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms