Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP1P32455 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP1P32455 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP1P32455 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP1P32455 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP1P32455 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP1P32455 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP1P32455 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP1P32455 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP1P32455 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP1P32455 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP1P32455 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP1P32455 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP1P32455 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP1P32455 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP1P32455 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP1P32455 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP1P32455 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP1P32455 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP1P32455 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP1P32455 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP1P32455 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP1P32455 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP1P32455 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP1P32455 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP1P32455 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP1P32455 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP1P32455 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP1P32455 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP1P32455 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP1P32455 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP1P32455 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP1P32455 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP1P32455 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP1P32455 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP1P32455 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP1P32455 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP1P32455 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP1P32455 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP1P32455 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP1P32455 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP1P32455 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP1P32455 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP1P32455 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP1P32455 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP1P32455 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP1P32455 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP1P32455 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP1P32455 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GBP1P32455 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP1P32455 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP1P32455 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP1P32455 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP1P32455 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP1P32455 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP1P32455 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP1P32455 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP1P32455 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP1P32455 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP1P32455 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP1P32455 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP1P32455 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GBP1P32455 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP1P32455 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP1P32455 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP1P32455 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP1P32455 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP1P32455 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP1P32455 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP1P32455 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP1P32455 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP1P32455 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP1P32455 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP1P32455 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP1P32455 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP1P32455 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP1P32455 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP1P32455 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP1P32455 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP1P32455 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GBP1P32455 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP1P32455 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP1P32455 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP1P32455 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP1P32455 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP1P32455 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP1P32455 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP1P32455 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP1P32455 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP1P32455 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP1P32455 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP1P32455 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP1P32455 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP1P32455 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP1P32455 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GBP1P32455 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP1P32455 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP1P32455 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP1P32455 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GBP1P32455 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms