Protein–RNA interactions for Protein: P30838

ALDH3A1, Aldehyde dehydrogenase, dimeric NADP-preferring, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH3A1P30838 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALDH3A1P30838 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALDH3A1P30838 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALDH3A1P30838 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms