Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP1P29466 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP1P29466 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP1P29466 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP1P29466 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASP1P29466 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP1P29466 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP1P29466 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP1P29466 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP1P29466 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP1P29466 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP1P29466 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP1P29466 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP1P29466 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP1P29466 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP1P29466 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP1P29466 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP1P29466 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CASP1P29466 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP1P29466 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP1P29466 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP1P29466 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP1P29466 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP1P29466 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP1P29466 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASP1P29466 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP1P29466 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP1P29466 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP1P29466 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP1P29466 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP1P29466 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP1P29466 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP1P29466 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP1P29466 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP1P29466 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP1P29466 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP1P29466 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASP1P29466 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP1P29466 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP1P29466 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP1P29466 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP1P29466 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP1P29466 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP1P29466 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP1P29466 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASP1P29466 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP1P29466 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP1P29466 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP1P29466 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP1P29466 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP1P29466 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP1P29466 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP1P29466 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASP1P29466 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP1P29466 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP1P29466 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP1P29466 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP1P29466 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP1P29466 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP1P29466 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP1P29466 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP1P29466 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASP1P29466 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP1P29466 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP1P29466 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP1P29466 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP1P29466 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP1P29466 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP1P29466 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP1P29466 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP1P29466 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP1P29466 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP1P29466 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP1P29466 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP1P29466 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP1P29466 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP1P29466 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP1P29466 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP1P29466 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP1P29466 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP1P29466 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASP1P29466 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP1P29466 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP1P29466 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP1P29466 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP1P29466 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP1P29466 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP1P29466 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP1P29466 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP1P29466 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP1P29466 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP1P29466 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASP1P29466 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASP1P29466 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASP1P29466 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CASP1P29466 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP1P29466 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP1P29466 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP1P29466 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP1P29466 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms